Tour de Ski 2008/09 bol tretí ročník série pretekov v behu na lyžiach, ktorá sa konal v Strednej Európe. Oproti posledným dvom ročníkom prišlo k zmene dejiska v Nemecku. Tour de Ski bude štartovať v Oberhofe, a nie v Oberstdorfe. Takisto sa zmenšil počet pretekov z ôsmich na sedem. Zo série totiž vypadol skiatlon.